研究人员对海豚粪便微生物群移植进行了首次同行评审研究

科学家们成功地对表现出胃肠道疾病迹象的海宽吻海豚进行了开创性的粪便微生物群移植。据国家海洋哺乳动物基金会的研究小组称,一只表面上生病的海豚在治疗过程中能够停止用药,食欲和精力恢复正常。该项目由NMMF、海海洋哺乳动物计划以及加州大学圣地亚哥分校医学院吉尔伯特实验室和斯克里普斯海洋学研究所联合开展,其研究结果发表在 应用微生物学国际出版物《应用微生物学杂志》上。通讯作者 Barb Linneha

科学家们成功地对表现出胃肠道疾病迹象的海宽吻海豚进行了开创性的粪便微生物群移植。

据国家海洋哺乳动物基金会的研究小组称,一只表面上生病的海豚在治疗过程中能够停止用药,食欲和精力恢复正常。

该项目由NMMF、海海洋哺乳动物计划以及加州大学圣地亚哥分校医学院吉尔伯特实验室和斯克里普斯海洋学研究所联合开展,其研究结果发表在 应用微生物学国际出版物《应用微生物学杂志》上。

通讯作者 Barb Linnehan 博士说,有胃肠道疾病证据的宽吻海豚接受了粪便微生物群移植治疗,并使用宏基因组测序分析了它们肠道微生物组的变化。

首创

这篇论文是第一篇在同行评审文献中描述粪便微生物移植(FMT)在海豚身上的应用的论文。在这项工作之前,只有少数在海洋哺乳动物中使用 FMT 的轶事案例,并且没有标准化的方法来安全筛选捐赠者、有效管理或监测其功效。

Linnehan 博士说:“这项工作对兽医界很重要,因为它强调了除抗生素之外的有效治疗鲸类胃肠道疾病的治疗选择,并描述了一种安全有效的方案来改变生态失调动物的肠道微生物群。”

“对我们来说,尽可能彻底和小心以确保海豚的安全是我们的首要任务,这一点很重要。

“为了不断推进海洋哺乳动物医学,我们开展了这个试点项目,突破了尚未经过严格探索的领域的界限。除了胃肠道疾病之外,菌群移植还有许多应用,这种疗法在未来有许多值得研究的可能性。”

非抗生素选择

胃肠道疾病在许多动物中很常见,包括野生和管理的海豚,而菌群移植提供了一种非抗生素选择,旨在恢复失调动物的有益肠道菌群。虽然人类医学领域关于 FMT 的文献比比皆是,但迄今为止,针对不同物种的兽医 FMT 研究却很少发表。

该项目的构想是兽医内科医生 Maureen Carroll 博士和海洋哺乳动物兽医 Barb Linnehan 博士之间的合作,Barb Linnehan 博士在兽医实习期间受到 Carroll 博士的指导。在波士顿安吉尔动物医疗中心,卡罗尔博士经常使用 FMT 来治疗患有胃肠道疾病的狗,并取得了巨大成功。

当 Linnehan 博士治疗一只患有生态失调的海海豚时,她联系了 Carroll 博士,请他根据人类和兽医标准推断出用于海豚的 FMT 方案。

第一只接受 FMT 治疗的海海豚表现出显着的改善,不再需要药物来控制胃肠道疾病。第一个试点案例的成功促成了与吉尔伯特实验室合作的这个临床项目,以更正式地评估海豚 FMT 背后的科学。

肠道菌群

在进行任何 FMT 治疗之前,研究小组首先测量了海豚粪便样本的基线细菌成分。

林内汉博士说:“我们将具有早期抗生素使用和胃肠道疾病史的受体海豚的肠道菌群与健康捐赠海豚的肠道菌群进行了比较。”

“通过宏基因组分析和对这两组海豚的比较,我们有兴趣看看健康海豚肠道微生物组与患病海豚肠道微生物组是否存在明显的特征。

“在这个阶段,我们惊讶地发现每只海豚的差异很大,并且存在的物种或某些微生物物种的丰度没有明确的模式来描述患病与健康的海豚——每只海豚的微生物组成都是独特的。

“然而,在大多数海豚身上也发现了常见的&luo;核心&ruo;微生物成员,包括来自细菌门 Candidatus Kryptonia的一种意想不到的菌株 ,它通常与地热泉环境有关。”

八种治疗方法

然后,研究人员对四只受体海豚进行了八次 FMT 治疗,将健康供体海豚经过彻底筛选的粪便结合起来,经直肠给予受体海豚。

“重要的是,我们没有看到接受者受到任何不利影响。通过鸟枪法宏基因组学,我们还能够观察 FMT 后新的供体物种向受体微生物组的植入,”Linnehan 博士说。

“植入的程度因每只接受者海豚而异。在 FMT 开始时表面上生病的海豚的反应最为剧烈。在治疗过程中,他成功停止了所有药物治疗,食欲和精力恢复正常。海豚临床结果的改善与 FMT 治疗后微生物多样性的增加同时发生。

储存健康粪便

“在该项目期间,我们还提出了一个有效的方案,用于储存健康的捐赠海豚粪便以供以后使用。这已被证明是有益的,因此当需要 FMT 时,我们可以使用健康的海豚粪便库。”

Linnehan 博士说,该项目是重要的第一步,也是未来研究的基石,以便海豚肠道微生物组和 FMT 治疗科学能够取得进展。

“我们已经证明,菌群移植可以在海豚身上安全地进行,并且对于患有胃肠道疾病和生态失调的动物非常有效,”她说。

抗菌素耐药性

“由于抗菌药物耐药性和抗菌药物管理是医学界的热门话题,因此将这种非抗菌药物作为治疗工具可以对海洋哺乳动物兽医有所帮助。这些工具和技术也可以应用于康复环境中的野生动物,包括高危、受威胁和濒临灭绝的海豚。

“这项研究只是探索 FMT 的使用以及海豚肠道中微生物随时间变化的开始。由于这是一项因全球大流行而中断的小型临床研究,因此未来有必要进行更大样本量和更长时期的研究。

“研究一年中不同时间不同饮食成分(即不同鱼类类型)下肠道微生物组的变化,或环境水质等其他外部因素的波动也很有趣。还有很多机会研究 FMT 治疗其他物种中记录的非胃肠道疾病,包括行为状况或延长寿命。”

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